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原核性であることは藍藻類と同様である．主な光合成色素としてクロロフィルa,
b またはディヴィニール・クロロフィルa, b とカロテノイドのβ-カロチンとゼアキサンチンをもち，酸素発生型の光合成を行い，フィコビリン色素をもたない．光合成産物はデンプンである．
藻体は球形または楕円形の単細胞の状態か，一列細胞糸である．二分裂による無性生殖で繁殖し，有性生殖は知られていない．
最初に発見されたProchloron は珊瑚礁に生育する群体ホヤに共生している（写真１）．はじめ藍藻の仲間とされ，色素組成などが明らかになって，藍藻類とは異なる藻類群であると認められた．その後，海洋プランクトンのProchlorococcus
と淡水プランクトンのProchlorothrix が発見された．
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